Direi che hai le idee abbastanza chiare
Da quanti litri è la vasca?? Mi pare di capire che sia un Rio...125, 180??
Si la sostituzione del neon.....
Sì il ghiaino 1-2 mm....
Sì alla modifica del filtro, i cannolicchi normali occupano troppo spazio, puoi usare cirax, mini siporax, Eheim Substrat pro, con i carassi puoi anche lasciare una sola spugna a grana grossa e tutto il resto cannolicchi.
Microsorum e anubias meglio se non le interri, vanno legate a legni/sassi.
Non usare il fondo fertile, ci pensano loro a fertilizzare, al limite puoi integrare con tabs vicino alle radici.