[dave81]

è chiaro sin dall'inizio che qui stiamo parlando di una vasca con un enorme filtro biologico, non di un olandese senza pesci e senza cannolicchi.. con tutti quei cannolicchi qui ci saranno nitrati in abbondanza e zero ammonio, quindi qui non ha senso parlare di ammonio (o di nitriti). se poi ci sono pesci, a maggior ragione ammonio e nitriti non ci devono proprio essere.
pesci o non pesci, nel momento in cui uno mette un biologico con 40 lt di cannolicchi vuol dire che non avrà mai ammonio in quella vasca (a filtro maturo), perchè il biologico serve proprio per eliminare l'ammonio tramite nitrificazione ossidativa. quello che voglio dire è che in questo caso la fonte di azoto per le piante sarà rappresentata essenzialmente dai nitrati. era questo il senso della mia frase. le piante in generale possono assorbire anche ammonio dall'ambiente esterno, ma in questo caso più che di ammonio io parlerei appunto di nitrati.

se invece parliamo dell'assimilazione a livello cellulare, il nitrato assorbito viene prima ridotto a nitrito nel citosol e poi il nitrito viene ridotto ad ammonio nei cloroplasti (nelle foglie) o nei plastidi (nelle radici). quindi il nitrato viene assimilato prima come nitrito e poi come ammonio.
l'ammonio ( quello assorbito dall'ambiente o quello derivante dalla riduzione assimilativa del nitrato) viene rapidamente trasformato in amminoacidi perchè è tossico.
l'ammonio è pericoloso perchè dissipa il gradiente protonico transmembrana, essenziale per il trasporto degli elettroni nella fotosintesi e per l'accumulo di metaboliti nel vacuolo. Infatti le piante assimilano l'ammonio vicino ai siti di assorbimento o di produzione e trasferiscono immediatamente nel vacuolo qualsiasi eccesso di ammonio, per ridurne gli effetti molto tossici. A differenza del nitrato, alte concentrazioni cellulari di ammonio sono tossiche anche per le piante, non solo per gli animali.