Sì

Se la plastica trasparente della plafoniera è sagomata, non è facile sostituirla con un foglio. Inoltre il silicone non fa presa sui materiali plastici (Plexiglas compreso).
Consiglio di togliere la plastica ex-trasparente e mettere le cuffie stagne.
Se ci sono difficoltà a farle stare nella plafoniera, si potrebbe anche eliminare del tutto la plafoniera, sospendere il neon al coperchio con delle clips e portare il reattore fuori dalla vasca.
Sarebbe utile qualche foto dell'impianto.