Dico la mia:
(1) se lo schiumatoio finora ti è andato bene, si deve individuare qual'è il problema e andrà bene di nuovo (lapalissiano, vero?)
(2) le bolle grandi e molto bagnate che non si aggregano dipendono quasi certamente dal fatto che è stato smontato e pulito.
(3) probabilmente la mancanza di quella "O"ring che funge da elastico rende ancora più instabile uno schiumatoio che già lo è di suo (questo può giustificare l'allagamento del bicchiere).
(4) il materiale nel silenziatore varia le prestazioni della pompa: se messo più compresso, in maggiore quantità o si sporca, riduce il passaggio dell'aria (il che può far aumentare il gorgoglio) facendo aumentare l'aspirazione dell'acqua. Anche questo rende più instabile (oltre che difficilmente tarabile) lo schiumatoio.
In sostanza devi (1) rimettere l'"O"ring riportando lo skimmer al suo stato iniziale e poi smettere di fare centomila cose (tra cui mettere anche in continuo le mani in vasca) altrimenti non capisci più niente; (2) devi lasciar lavorare lo skimmer (con l'"O"ring) senza toccarlo per qualche giorno, come fosse nuovo, per farlo ri-stabilizzare, poi lo tari.
Ti avevo detto di darmi una misura per quella "O"ring, ma mi hai snobbato.....