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Se puoi, potrebbe essere più figata (con notevoli vantaggi estetici) fare i fori per caduta e mandata sul vetro posteriore, stile xaqua.
Sulle dimensioni dei fori non mi pronuncio, dato che io e il fai da te siamo due cose mooolto diverse.

Per le dimensioni della vasca quoto 90x50x50, nel caso tu non faccia dsb. Va benissimo anche alta 60, anzi è ancora più bella, ma tieni conto che più è alta e più dovrai forzare con l'illuminazione (ovviamente dipende anche se inserirai coralli avidi di luce oppure no).
Non la farei assolutamente con profondità inferiore a 50, anzi se puoi falla 90x60... altrimenti rischi di far fatica con la rocciata o di dover rinunciare a qualche soluzione di rocciata esteticamente più valida.

Per il tempo da dedicare alla vasca non c'è una regola generale... sicuramente lo startup è più delicato perun acuqario marino e dovrai/vorrai perderci più tempo. Poi dipende anche da quali coralli inserirai. Nella mia vasca (92x50x52) ospito tutti coralli robusti (anche sps ed lps) e adesso che sono a regime (o quasi) non ci dedico più di mezzora al giorno... pappa per i pesci, occhiatina al funzionamento di tutte le attrezzature, raddrizzo qualche corallo quando gli amici paguro e riccio combinano guai, eventualmente qualche alimentazione mirata ogni tanto.
Insomma, niente di così impegnativo.
Se invece vuoi una vasca super top tirata con supermegaacroporecoloratedafarpppaura... allore forse bisogna sbattersi un po' di più.

Dimenticavo: inizia a pensare all'illuminazione. Sulla mia uso 8x39 T5 con buona soddisfazione. Decisamente meno impegnativi dei led come spesa iniziale, però alla lunga... vedi tu.