secondo me non si tratta di alga ma di qualche forma di fungo o colonia batterica probabili cianobatteri ma con metabolismo anossigenico in quanto dalla tua attenta descrizione possiamo dedurre che non ama zone ossigenate, infatti cresce tra ghiaietto e vetro e che ama la luce data l'esposizione della vasca ai raggi solari.
A questo punto proverei a mettere del nastro isolante nero, quello degli elettricisti per intenderci lungo il vetro e la linea delle formazioni rosse e schermare così la luce (in questo modo ho debellato in una vecchia vasca i ciano che si venivano a formare tra ghiaia e vetro) e magari controllare che il giro dell'acqua interessi tutta la vasca o cercare di smuoverla vicino al fondo in modo da ossigenare..sono tentativi..non ho mai visto una cosa del genere.
Coraggioso tenere per tanti anni una vasca con tanto sbalzo dal piano...
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