Cure prolungate con dosi massicce di antibiotico, oltre al problema evidenziato da daniele68, possono mettere in pericolo le colonie batteriche utili nella vasca, quindi a fine cura, sarà meglio monitorare i nitriti per un po'.
Non credo esista un antibiotico mirato per i cianobatteri, ma sembra siano gram-negativi, il che può essere un aiuto nella scelta dell'antibiotico più efficace
Perchè fare cambi acqua dopo il trattamento con perossido di idrogeno? Da quel che mi risulta, dopo poco l'ossigeno atomico che viene liberato fa il suo dovere di ossidante legandosi in molecole innocue ed il resto diviene semplicemente acqua.