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Originariamente inviata da qbacce
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Interessante in generale o hai qualche idea precisa??
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alcuni pezzi tradotti con google
mi sembrano molto interessanti i riferimenti ad aminoacidi e protezione dai raggi uv
se riuscissi a tradurre meglio -28d#
Per ovviare alla mancanza di dati molecolari per ermatipici coralli, abbiamo determinato l'intera sequenza del genoma, di
A. digitifera (
fig. 1a-h ), una specie dominante sulle scogliere di Okinawa. Non solo sono specie
Acropora dominante ermatipici coralli del Indo-Pacifico, ma sono anche tra i più sensibili dei coralli a temperature dell'acqua di mare maggiore
8 .
Ermatipici coralli tipicamente abitano acque tropicali poco profonde e relativamente chiara e sono quindi costantemente esposti ad elevati livelli di irradiazione ultravioletta. Come coralli sono particolarmente suscettibili alle sbiancamento quando esposto a temperature sia rialzato e un elevato irraggiamento solare
2 ,
4 , una domanda interessante è come i coralli si proteggono contro i danni ultravioletti. Foto-protettiva composti, come gli acidi mycosporine aminoacidi (MAA), sono stati isolati da coralli
15 ,
16 ma, in quanto composti simili sono stati identificati nelle alghe, le fonti di questi composti erano sconosciute. Recentemente un breve (quattro fasi) percorso codificato da un cluster di geni (DHQS-like,
O-MT, ATP-afferrare e PNR-like) (
Fig. 2. e
supplementare Fichi 12/09 ) è stato dimostrato essere necessarie e sufficiente nel cianobatterio
Anabaena variabilis per convertire pentoso-fosfato metaboliti shinorine, un foto-protettivo MAA
17 . La scansione del disponibile con tutto il genoma dei dati ci ha permesso di identificare omologhi chiara di tutti e quattro i membri del cluster cianobatteri gene shinorine sia
A. digitifera e
N. vectensis (
Fig. 2. ), indicando che sia il corallo e l'anemone di mare hanno la capacità di svolgere la sintesi
de novo di raggi ultravioletti di protezione composti. Quindi, in sintesi MAA coralli e altri cnidari non è simbionte dipendente.
sondaggi di
Acropora di geni associati con l'immunità innata
18 , l'apoptosi
19 e autofagia
19 indicano non solo la complessità di questi sistemi in
Acropora (
supplementare Fichi 13
), ma anche che il corallo repertorio immunitaria innata è più sofisticata di quella di
Nematostella. Per esempio, mentre un singolo canonica verde / TLR proteina è presente in
N. vectensis 18 , il genoma codifica
Acropora almeno quattro molecole quali, oltre a cinque IL-1R proteine &
03;&
03;correlate e un certo numero di TIR solo proteine &
03;&
03;(
Fig. 3. ). Allo stesso modo, il repertorio di
Acropora NACHT / NB-ARC domini, che sono caratteristiche di primaria recettori intracellulari modello
20 , è ancora molto complesso: un ordine di grandezza più NACHT / NB-ARC domini sono presenti in corallo che in altri animali (
Tabella supplementare 11 ), e alcune di queste proteine &
03;&
03;cnidari hanno strutture dominio romanzo (
Fig. supplementare. 23b ). In termini di espansione e apparente divergenza di NACHT geni che codificano, il corallo assomiglia anfiosso
21 , il riccio di mare
22 e angiosperme
23 . La maggiore complessità della rete di corallo immunità innata può in parte riflettere adattamenti associato allo stato simbiotico e colonialità.
una serie di corallo specifiche famiglie di geni è probabile che si sono evoluti nel contesto di calcificazione. Questi dati forniscono anche una base per la biologia dei sistemi approcci alla comprensione della, funzione di creazione e crollo della simbiosi corallo. Se e quando un intero genoma sequenza diventa disponibile per il simbionte dinoflagellato di coralli
Symbiodinium sp. (Zooxantelle), queste risorse, insieme, forniscono ulteriori prospettive su simbiosi e una potente risorsa per la comprensione della risposta del holobiont a stress ambientali come ad esempio all'aumento delle temperature l'acqua di mare o l'acidificazione degli oceani.
...si ....
Modalità lineare
