Il fatto che abbia perso la prima riproduzione è alquanto strano, da questo punto di vista i Multi sono piuttosto autonomi e portano avanti i piccoli senza grandi problemi.
Per avere un quadro più dettagliato, di quanti litri è la vasca? I valori sono tutti in regola? Hai gusci/rifugi a sufficienza anche per i piccoli in modo che possano nascondersi se si sentono in pericolo?
Trattandosi di un monospecifico ( se ho capito bene ) non ci sono problemi che possano finire nel filtro, basta che abbiano gusci in quantità e vedrai che vanno avanti tranquilli.
La pompa di movimento ti serve perché il filtro ha una pompa piccola? Quanti litri/ora?
Di solito per un allestimento Tanganyica si usa un filtro sovradimensionato ed è sufficiente quello. In caso la pompa di movimento potrebbe anche non servirti.
Non so dirti sulla possibilità che ora non vengano riconosciuti dai genitori, serve il parere degli esperti del Tanganyica

Comunque non puoi tenerli sempre nella nursery e prova quindi a liberarli. Tienili sotto controllo, se hanno spazio e gusci a sufficienza non dovrebbero avere problemi ad integrarsi.
Per l'alimentazione è importante variare il più possibile, il granulato va benissimo, anche i fiocchi della Tropical ( specifici per Tanganyica ) non sono male.
Per gli avannotti uso il "Grade 12 elite" della Blu Line. Da consigliare anche l'uso di cibo congelato ( mysis, artemia, krill ) da sciacquare molto bene e spezzetare prima della somministrazione.