Alyangel, come tu stesso hai potuto appurare, il Rio Madeira è un fiume di acque bianche, quindi molto torbide e ricche di particolato in sospensione. Questo rende difficoltoso, alle piante, effettuare una efficiente fotosintesi sotto la superficie dell'acqua. Ecco perché hai trovato poco o nulla ed ecco perché il fiume è infestato da Eichhornia crassipes. Essendo una pianta galleggiante, non ha alcun problema legato alla torbidità del fiume.
Ovviamente in un acquario eviterei l'Eichhornia (come eviterei l'acqua così torbida....
), sostituendola con il Limnobium laevigatum, che comunque è centro-sud americano e anche cosmopolita.
Quindi, o metti solo galleggianti, oppure inserisci delle piante cosmopolite, come potrebbero essere il Ceratophyllum demersum o la Najas guadalupensis. O anche specie meno attinenti ma ugualmente "amazzoniche", come le Echinodorus.