C'è chi lo fa: a detta loro le alghe rimangono molto più "spiazzate" da questo "trambusto luminoso" rispetto alle piante e piano piano spariscono.
La luce della stanza, se è di tipo artificiale, ben difficilmente avrà influenza su quanto accade in vasca, almeno non con le consuete illuminazioni domestiche di max 150

0W di un lampadario o di una plafoniera a muro con alogena.
Se la luce è quella del sole diretta, invece, è assolutamente consigliabile spostare l'acquario da lì perché non vi arrivi!
Più che un problema vegetale, anche secondo me, l'interruzione del fotoperiodo sarebbe un po' stressante per i pesci.