Direi di sì.
Estremizzando: se metti uno skimmer in acqua dolce, non schiuma per niente (o almeno, non riesce a formare quell'elevato numero di piccole bolle, tali da essere utili... ma vedremo dei grossi bolloni) e più l'acqua tende a essere salata, maggiore sarà l'efficienza dello stesso.
Ovviamente non ho mai provato a mettere uno skimmer in acqua dolce..... pertanto accetto smentite.