Per prima cosa, qualsiasi cosa tu decida da fare con il fondo, meglio spostare tutti i pesci.
La seconda cosa: una foto, aiuterebbe molto
La terza cosa: se tu metti della sabbia fine o qualsiasi altro materiale sopra la ghiaia grossa, prima o poi, quella grossa viene su (aspirazione fondo, cambio d'acqua, ecc.).
L'unica cosa che ti posso suggerire, è di mettere una rete sopra la ghiaia grossa (anche quelle oscuranti) e poi mettere quella fine. Ma non è un gran bel vedere

o meglio: dovrai lavorare un bel po' e munirti di tanta pazienza.
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P.S. a me sembra troppo fine per il tuo "problema" quella sabbia lì e va a finire che va tutta sul fondo, rete si, rete no. Sceglierei una granulometria diversa: da uno a tre millimetri.
Se fosse mia la vasca, metterei questo:
Bio Dry Quarzo Mix