Per risistemare sicuramente di tempo ne vorrai di più. Il filtro non si tocca.
Le piante potresti provare a toglierle e pulirle in secchi con lavaggi di acqua ossigenata (non in acquario). Il legno puoi bollirlo... Il ghiaino pure... Fare un bel cambio d'acqua(70%) e far girare il filtro.
Il pmdd di cui ti parla luca e che uso anche io, ci permette di fare cambi diradati e immissioni di fertilizzanti a bisogno delle piante non a schema, ma inizialmente può essere difficile da "assimilare".