La vasca mi sembra messa bene, vai di bollitura della ghiaia se non vuoi prenderla nuova!
I vetri, se li avevi già puliti quando l'hai dismesso, puliscili normalmente ed eventualmente se dovessi notare qualche incrostazione prova a usare l'aceto.
Riguardo all'avvio:
1) Cannolicchi/sferette (da vedere se possono stare assieme o se bisogna utilizzare solo una di quelle) e lana perlon nel filtro
2) Metti la ghiaia sul fondo ed eventualmente gli arredi e le piante, che possono essere messi anche successivamente
3) Riempi la vasca con l'acqua, tramite vasi comunicanti o come ti viene meglio, adagiando sul fondo un piattino o una ciotola pesante
Il substrato fertile è utile se devi piantumare molto e utilizzare piante che assorbono dalle radici come le Cryptocoryne o le Vallisneria o altre ancora, in alternativa puoi utilizzare delle pastiglie da fondo in sostituzione al substrato fertile