Alcuni schiumogeni antincendio sono fatti (forse meglio dire erano) con farina di legno, farina di ossa e cose simili ... ma ormai l'acqua è 'inquinata' (ammesso che sia questo), anche togliendo il legno non ho idea se il problema si risolve o meno.
Ovvio che alla fine decidi tu cosa fare, i miei sono semplici ragionamenti

... comunque hai 30gg di tempo per la maturazione, ammesso che il tutto non stia dando problemi ai batteri nitrificanti