Anche il fondo funziona da filtro, quindi cambiandolo riduci la capacità filtrante.
Ipotizziamo che nn ti crei problemi ma senti altri pareri... procederei così:
Vuota per almeno tre quarti il vecchio acquario raccogliendo l'acqua in taniche: spostare un acquario con 50 litri di acqua più il peso del fondo secondo me rischi che ti si spacchi in mano!
Metti quello nuovo al suo posto allestendo il fondo, sposti il filtro, poi aggiungi un po' d'acqua e metti le piante, poi versi la restante acqua delle taniche (attento a nn smuovere il fondo) a questo punto sposti i pesci e travasi la restante acqua.
Il flitro lo puoi lasciare spento anche un paio d'ore, ma sempre con la sua acqua dentro, nn deve asciugarsi.
Finito il travaso io userei comunque un attivatore batterico per sicurezza...
Ripeto senti altri pareri perchè nn sono sicuro di quel che ho detto
Unica cosa di cui sono quasi sicuro è nn spostare l'acquario con 50 litri d'acqua dentro