Ci sono un po' di possibilità.
Se vuoi solo coprire la vasca per evitare evaporazione eccessiva e/o fughe di pesci che saltano puoi mettere anche solo un coperchio in vetro piano secondo questo progetto:
http://www.acquariofilia.biz/blog.php?b=171
In tal caso le luci, di solito, vanno posizionate sopra i pannelli di vetro.
Se vuoi fare un vero e proprio coperchio con le luci sotto di esso, una delle soluzioni, che ho sperimentato io in passato, potrebbe essere il Plexiglas, Perspex o simili (sono nomi commerciali per il polimetilmetacrilato) dandogli una forma a tronco di piramide, così facendo è difficile che si deformi e puoi attaccare i neon sotto il coperchio con delle clips (tipo queste:
http://www.aquariumline.com/catalog/...ne-p-6672.html
Ovviamente, se ne hai la possibilità/capacità, puoi farlo anche in altro materiale, lamiera acciaio inox o alluminio o policarbonato oppure legno impermeabilizzato.
Qualunque materiale tu usi, se a lavoro finito il risultato non dovesse risultare sufficientemente estetico, vi sono quei fogli di plastica adesiva in una miriade di colori e/o pattern che trovi in hobby center o anche in cartolerie ben fornite.