ti compri due timers (i meccanici costano meno e a me hanno sempre funzionato meglio) e alterni le pompe con un intervallo di tempo a tua scelta. di solito si sceglie un numero divisore di 24

Personalmente le alterno ogni 6 ore. quindi una accesa da mezzanotte alle 6, si spegne e parte l'altra fino a mezzogiorno e così via.
Le puoi alternare anche ogni 4 ore, o ogni 8.
Se avessi una terza pompa probabilmente terrei alternate le due grandi di giorno e lascerei la terza (più piccola) di notte per 6 ore con le altre 2 spente.
P.s.
non si rompono se sono prodotti di qualità (come le koralia) sono testate non so quante volte.. certo che se le accendi e spegni ogni 2 minuti tanto bene non gli fa ma con intervalli di ore, timerizzate non danno nessun problema