Pescio, che intendio dicendo che arriva un po' di luce? il problema delle finestre sussiste solo se i raggi del sole colpiscono direttamente i vetri.
le alghe che descrivi sono normalissime e vanno tolte con una lametta, ci sono in tutti gli acquari.
cfr 
http://www.acquaportal.it/_ARCHIVIO/...puntiformi.asp
ciao, ba