Il resoconto di un incidente simile andato più o meno a buon fine io l'ho trovato qui:
http://www.vergari.com/Acquariofilia/Pangio01.asp
Vedi la terza parte dell'articolo.
In sostanza il problema pare sia stato risolto senza dover rifare l'acquario con cambi ravvicinati, areatore e movimento dell'acqua e carbone attivo nel filtro.
Anche a me capitò ma in misura fortunatamente piccolissima e non fu necessario intervenire pesantemente. Me la cavai con un bel cambio d'acqua e mezza giornata d'areatore.