Il ghiaino.. prima di rimetterlo verificherei com'è.. se calcareo (ne prendi una manciata e ci metti del viakal.. se "frigge" lo è) nn lo mettere, oppure se magari è troppo grosso o tagliente in caso volessi metter i cory ecc..
I cannolicchi se son stati in acqua ferma o cmq a secco son solo sporchi, i batteri son morti, sciacquali bene (lasciandoli magari in ammollo in acqua bollente).
Assicurati piuttosto visto che stai partendo di farlo nel modo giusto.. quindi leggiti in acquaportal gli articoli base e magari chiedi consiglio..
Puoi mettere magari prima del ghiaino del fondo fertilizzato se vorrai inserire poi più piante, vedere se riempire il filtro anche con altro, se serve qualcosa, ecc ecc
Buon lavoro