Ma perchè, almeno all'inizio, non lasciate funzionare i filtri secondo progetto?
Chi li ha progettati non sarà proprio deficiente!
Il consiglio per il momento è di ripristinare, se puoi, le condizioni iniziali del filtro. Poi eventualmente vedremo di capire dove sia il problema.
Da quanto è in funzione? E' possibile che sia già intasato?
Se ricordo bene in quel filtro ci sono i canolicchi prima della spugna, è così?
Prova anche a togliere il tubicino forato della mandata e vedere se così la portata è decente.
Il tubo di aspirazione è tutto come di serie o hai modificato anche quello (magari per evitare l'aspirazione di avannotti)?