Io ho fatto come te, avevo un ghiaino rosetta, ne ho aspirato un po' e ho aggiunto del ghiaino nero con il seguente procedimento (per non creare shock ai pesci e alle piante)
Prendi un tubo da 12mm rigido, quello che vendono nei negozi di acquari, quello verde trasparente che si piega o puoi modellare con il calore per intenderci, lo tagli per l'altezza della vasca in modo che superi il livello dell'acqua di circa 10cm, in una estremità infili un imbuto col beccuccio stretto, io uso quello della stirella (così rendo felice mia moglie

). Infine con l'aiuto di un cucchiaio verso direttamente il nuovo ghiaino sul fondo senza farlo "svolazzare" per la vasca e indirizzandolo con precisione nei punti che ritenevo più opportuni.
Io questa operazione l'ho fatta in 2/3 tranche in modo da creare meno scompiglio possibile

Il procedimento è un po' lungo ma molto preciso e poco devastante.
Ciao