Aspetta persone più qualificate.
Da parte mia posso dirti
1 se puoi è meglio togliere tutto e pulire bene, altrimenti se la gestione sarà ottima piano piano dovrebbero sparire comunque.
2 la soluzione del legno che hai usato non mi convince. Anch'io avevo fatto lo stesso (spendendo pure per comprare silicone adatto), ma un bel giorno mi sono ritrovato tutto sotto sopra.
Sai come ho risolto io? Ho preso un pezzettino di plexiglas, ho fatto due fori, un foro al legno e ho legato il tuto con delle striscette tipo elettricista però verdi. Una volta poggiato sul fondo, la ghiaia (o il terriccio) poggiano sul plexiglas che così rimane fisso a terra.

Ti posto la foto di un pezzo..
"...la vita è un equilibrio sopra la follia..."