Esattamente la seconda cosa che hai detto.
Metti il diffusore più in basso possibile sotto l'uscita del filtro così le bolle vengono portate a spasso per la vasca e restando più a contatto con l'acqua avrai una maggiore quantità di anidride carbonica disciolta
Fai una ricerca sul sistema venturi per anidride carbonica che potrebbe esserti utile.