Imho qui quello che è successo è che con quelle poche piante e tutto quel caldo l'ossigeno é iniziato a scarseggiare, qualcosa è morto (e perché no anche gli stessi batteri) e, avendo sicuramente tu un acqua piuttosto alkaline li dentro, fatto reazione a catena con produzione di ammoniaca.
I nematodi non sono sicuramente al causa, semplicemente quando non hai pesci si moltiplicano in maniera incontrollata e li vedi