O metti un fondo fertile oppure lo metti inerte.
Forse intendevi della sabbia per coprire il fondo fertile? Nel caso meglio scegliere sabbia non calcarea (di fiume presa al garden costa pochissimo, ma eventualmente va testata per la presenza di carbonato di calcio) per coprire il fondo fertile.
Ovviamente nel caso tu voglia piantumare con piante dall'apparato radicale "importante". Altrimenti va benissimo un fondo solo di sabbia (o ghiaia fine, dipende anche dalle specie ospitate, pesci di fondo, ecc.).