Ho visto anche io la stessa vasca (ho comprato anche i discus lì), e devo ammettere che quando lo ha consigliato a me, io mi ci sono trovato in pieno, cioè si è comportato da fondo inerte.
Comunque disfare tutto mi sembra esagerato, visto che ormai hai pagato il fondo e visto che a quanto mi pare di aver capito, il fenomeno è solo iniziale. Io lascerei maturare un mese e lascerei "sfogare" il manado, per poi aggiustare i valori con l'acqua tenera che ti esce dal rubinetto (tanto ormai i batteri avranno colonizzato sia il filtro che il fondo).
Però sono scelte ...