il discorso è un po complesso....
eliminando i canolicchi hai sicuramente contribuito all' abbassamento dei nitrati, risultato del metabolismo dei batteri aerobici (quelli nei canolicchi del biologico) che lavorano cioé in presenza di ossigeno.
Gran parte dei batteri che si instaurano nelle rocce vive sono invece batteri anaerobici, che lavorano cioè in assenza di ossigeno. Questi metabolizzano nitriti e nitrati trasformandoli in azoto....sostanza innocua alla vasca
tutto questo spiegato in modo forse troppo sintetico e semplificato
prende il nome di ciclo dell' azoto
spero di essere stato abbastanza chiaro