La pompa puoi anche metterla dove hai detto, verifica solo che l'acqua in uscita dal filtro circoli poi in tutta la vasca, la pompa di solito la si mette nel punto + lontano dall'uscita del filtro cosi' da creare un "cerchio" nel flusso, ok la spiegazione fa paura
pero' credo che hai capito che e' essenziale non lasciare zone senza corrente\ricambio d'acqua