E' normale che le crypto abbiano dei momenti di "depressione" e talvolta perdano anche tutte le foglie per poi riapparire. Se poi l'hai appena piantumanta potrebbe essere un semplice stress da spostamente: le crypto sono molto delicate da questo punto di vista, soffrono anche se spostate troppe volte in punti diverse della stessa vasca.
Non credo che centri qualcosa il filtro.
Nella piantumazione cmq hai spuntato un pò le radici? Hai un substrato fertile?