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Non sarà che i nitrati sono dovuti ad una potatura un pò drastica che ha fatto si che i nitrati normalmente assorbiti si accumulassero invece nell'acqua?
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Potrebbe essere una possibile causa,diciamo che è buona cosa(quando si deve dare una sistemata alla vasca)potare 2 piante per volta e ogni potatura distanziarla di 4gg,questo perche le piante quando vengo recise subiscono uno shock bloccando il loro ciclo di crescita per un x tempo(appunto di 3/4gg),per poi riprendere.
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Per il pH cosa posso fare? smetto con la co2 per un pò? (non è che l'impianto a lievito ne faccia poi così tanta anche perchè aspetto almeno una o due giornate prima di inserirlo).
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Io direi che nn è la co2 il reale problema del valore del ph, vedi con un valore di 3° di kh(hai un acqua di rubinetto buona se esce con quel grado) è normale che la co2 faccia scendere il ph( ameno che questo nn si proprio il valore del ph dell'acqua di rubinetto,ma ho i miei dubbi),secondo me dovresti lavorare sul kh(portandolo a 5°/6° ) è questo che fa da tampone al ph.
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La "regola" l'ho letta da qualche parte, non ricordo dove, comunque dici che è il caso di ridurre ulteriormente il numero di guppy?
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Una riduzione della popolazione nn potrà che giovare allo stato di salute della tua vasca.