L'acqua sarà trasparente come il cristallo, ma sarà pure color ambra per lungo tempo. Poco o nulla da fare (il carbone,la zeolite etc....agiscono pochissimo in questi casi).
Per la temperatura delle piante penso che non sia un problema: quasi sicuramente la tua vasca avrà 25

°C e questa temperatura va bene per la stragrande maggioranza delle piante.