L'ipotesi 2 io la scarterei, mi sempra poco probabile..
L'ipotesi 1 invece, a mio parere, non è da escludere.
Il fatto che dopo aver cambiato l'acqua si siano ripresi però mi fa pensare non a una malattia, ma a qualcosa che non va nei valori..
Sarebbe meglio che scrivessi qualche informazione in più, per esempio: volume vasca, data di avvio, popolazione, valori (dire che i valori sono ok vuol dire tutto e niente
)