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E' obbligatorio che la pompa sia sempre accesa, in quanto nel filtro vanno ad insediarsi sia batteri aerobici che anaerobici.
Quelli aerobici hanno bisogno di un lento e continuo flusso d'acqua che porti nuovo ossigeno, in quanto altrimenti morirebbero soffocati bruciando tutto l'ossigeno dell'acqua che vi ristagna nei dintorni.
Proprio per questo motivo il filtro non deve rimanere spento a lungo, in quanto causerebbe la morte di molti batteri e il collasso del filtro stesso
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