Si tratta perlomeno di una situazione anomala.
Non sono un grande esperto ma direi che la fertilizzazione dovrebbe farli diminuire visto che, presumibilmente, fornisci elementi che creano le condizioni per la crescita delle piante e quindi per l'assorbimento dei nitrati.
Se vuoi un aiuto bisognerebbe avere qualche informazione in più sulle caratteristiche della vasca e sul tipo di fertilizzante che hai utilizzato.
Edit:
Ho dato un'occhiata solo ora al tuo profilo (non sono abituato a vederli compilati
).
Credo che la causa sia la popolazione un po' spinta della vasca e non la fertilizzazione.