Se il pelo dell'acqua delle due vasche è allo stesso livello in linea teorica potresti farlo semplicemente attivando un sifone tra le due vasce ed inserendo la mandata in una e la ripresa nell'altra.
Nel tuo caso però data la differenza di litraggio la portata che va bene nel 100 lt ti creerebbe un movimento da fiume in piena nel 20 lt per cui la vedo poco praticabile come soluzione. Inoltre se disgraziatamente si dovesse ostruire il collegamento tra le due vasche una delle due si svuoterebbe nell'altra con conseguenze disastrose.
Personalmente lascerei perdere e opterei per due filtri indipendenti, per il 20 lt in fondo non dovresti spendere molto
