Allora fermi tutti
Andiamo per ordine...
La misurazione dei nitriti è assolutamente necessaria per capire quando la vasca sarà pronta. Infatti durante la maturazione si sviluppano particolari ceppi batterici che trasformano le sostanze di scarto in sostanze via via meno dannose. I nitriti sono il penultimo anello della catena, e quello più importante perchè sono estremamente dannosi. L'acquario può dirsi avviato solo quando i nitriti, dopo essere aumentati, diminuiscono fino a diventare zero, trasformandosi in nitrati.
Dopo 15 gg ci sono poche probabilità che il tuo filtro sia gia pronto, e la presenza di nitrato è, secondo me, imputabile all'acqua di rubinetto che evidentemente gia ne conteneva.
In fase di maturazione NON si effettuano cambi d'acqua proprio perchè in primo luogo potresti non accorgerti del picco, in secondo luogo perchè rallenti e di molto la maturazione.
Ma ormai il danno è fatto. Ti direi di comprare un buon test a DOPPIO reagente per gli no2 e tenerli sotto controllo. Non effettuare altri cambi fino a che i nitriti non saranno scesi a zero e i nitrati saranno aumentati.
Per la radice, lascia tutto com'è. L'acquario è un ecosistema che deve stabilizzarsi. Le muffe sui legni sono assolutamente normali e innocue. Cosa intendi per detriti rilasciati? l'acqua si colora di marrone? se si non fa nulla, anzi ai pesci che ci abiteranno farà anche bene. Sta al tuo gusto estetico scegliere. In ogni caso non cambiare ulteriormente l'acqua.
In merito all'uso o meno dell'acqua di osmosi...tutto dipende dalla fauna che vorrai inserire in vasca...hai già un'idea?