Ciao, il carbone attivo deve essere usato per eliminare residui di medicinali oppure per pulire l'acqua troppo torbida. L'uso continuo è sconsigliato in quanto il carbone trattiene, oltre ai medicinali, i nutrienti per le piante. Per abbassare i nitrati
devi fare cambi d'acqua ravvicinati (con acqua senza nitrati ovviamente). La prima regola è, comunque, mettere tante piante. Nel tuo caso specifico dovresti mettere molte piante a crescita veloce.
I tuoi batteri non è detto che siano insufficienti. Il loro compito è proprio quello di
"convertire" le sostanze più dannose (vedi nitriti) in nitrati che sono molto più sopportabili dai pesci e utili alle piante.
Dovresti scoprire comunque come mai si formano questi nitrati alti ( a proposito, valori?). Controlla che non ci sia qualcosa che sta marcendo in acqua, non eccedere con il cibo ( ai pesci naturalmente

) etc etc.
Spero di non essere stato troppo lungo.