Penso che se si sentisse odore di ammoniaca in vasca sarebbe già tutto sterminato. Credo che neanche i cianobatteri c'entrino qualcosa.
PaoloG, per adesso lascia in pace le lumachine, stanno contribuendo, per quel che possono, a pulirti la vasca, anzi non è escluso che ti abbiano salvato da danni più gravi. Vai con il cambio acqua sifonando anche un po' il fondo e, come ti è già stato detto, pulisci/sostituisci i primi materiali di filtraggio meccanico. E digiuno per almeno 3gg.
Per favore fai ora i test (tutti quelli che hai) e riporta qui i valori, anche piccole variazioni possono essere utili a capire la situazione
