Si, i Neon richiedono un'acqua con Ph inferiore a 6. Il PH può essere abbassato filtrando l'acqua con torba o aggiungendo un impianto di CO2, anche artigianale (a gel).
Togli il carbone dal filtro, al momento è inutile.
Le piante puoi inserirle subito, non sono influenzate dai nitriti e contrastano la crescita delle alghe.
Per i legni ti rimando a questo utilissimo thread:
http://www.acquariofilia.biz/viewtopic.php?t=243277