allora, essenzialmente per creare un laghetto come dici tu la cosa più semplice è mettere delle lastre di plastica nel substrato che dividono il substrato inondato da quello asciutto dove radicheranno le piante
per il filtro, non ne hai bisogno, l'unica cosa di cui hai bisogno è una pompa che pesca l'acqua nel caso tu voglia fare cascate e simili, il filtro non serve perchè non alleverai animali che vivono in acqua, dato che 4 cm di altezza sono un pò pochi per farci vivere un animale completamente acquatico dentro
qui qualche idea
http://brianstropicals.com/building.html
come vedi in questo caso, per fare il laghetto sono stati posizionate delle lastre nel terreno per contenere l'acqua e in fondo c'è una pompa che porta in alto l'acqua
altra possibilità è quella di abbandonare il substrato e fare tutto in poliuterano e polistirolo come qui
http://www.caudata.org/forum/showthread.php?t=38607
terza ipotesi è quella di fare un doppio fondo alto 4 cm, sotto scorre l'acqua del laghetto, e sopra il doppio fondo c'è la terra del terrario
purtroppo non riesco a trovare un link per spiegare meglio
magari se posti un'immagine del terrario a tua disposizione posso esserti più di aiuto