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Scusa mordor, credo che tali problemi siano risolvibili cambiando gestione, più che "resettando" l'acquario. Altrimenti nel nuovo acquario si ripresenteranno, inesorabilmente, di nuovo.
Per esempio: è un classico che le lumache si moltiplichino se fornisci loro troppo cibo (cioè se nutri troppo i tuoi pesci). Questo comportamento, alla lunga, inquina l'acqua e porta, appunto, a patologie di vario tipo.
Un'ultma osservazione: i tuoi pesci non stanno ancora perfettamente bene e tu rivoluzioni l'acquario? Aspetterei, nel caso, che si rimettessero del tutto, eventualmente correggendo eventuali squilibri della vasca.
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