[Miranda]

lucapoz, non credo che eliminando i guppy risolveresti il problema.
Come di suggerisce Dark_70, solo con esami di laboratorio puoi essere certo che si tratti di quel parassita, altrimenti vai a tentativi e non è una buona cosa.
Io la capillaria in vasca FORSE l'ho avuta, però non attaccava solo i guppy, ma anche gli altri poecilidi, non ho la certezza assoluta che fosse quella, ma in ogni caso dopo un certo periodo di sanità apparente, è bastato comprare un trio di platy in un negozio che dopo qualche tempo la morte di qualche pesce con dimagrimento s'è ripresentata, e questo soprattutto in concomitanza con l'estate.
Per assurdo (ma non tanto), per esser sicuro che il problema non si ripresenti in futuro, una volta rifatta la vasca e disinfettato tutto dovresti evitare di acquistare pesci dai negozianti, e quindi dovresti "produrteli" da solo.