se non vedi pesci morire improvvisamente ed in numero elevato non ti preoccupare più di tanto
certo la cosa preoccupante è che questo 'gas' puzzi, ne sei certo ? 
anche io ho periodi in cui vedo bolle d'aria fuoriuscire dal fondo ed ho capito che è semplice ossigeno che si forma quando, per vari motivi, vado a piegare/spezzare le radici delle piante (ne ho alcune uscite in superfice e potando ne ho intaccate alcune notando un pearling notevole pertire proprio di li
)
oltre a quanto detto, potrebbe essere semplice metano proveniente dalla 'putrefazione' batterica di residui di mangiare o foglie o semplice cacca
comunque procurati un bastoncino tipo ristorante cinese bello lungo e inseriscilo nel fondo piano ruotandolo mentre va giù, in questo modo aiuti le bolle d'aria a venire su
visto che hai comprato l'attrezzo fai una bella sifonata alla vasca (dividila in zone e fai una zona al giorno) controllando i nitriti, purtroppo insieme alla schifezza tirerai via un bel po di batteri utili -28d#
se il ghiaietto è quello del link dovresti avere 20cm di fondo per avere delle zone anossiche e/o vasca avviata da un paio di anni senza aver mai fatto pulizie del fondo ... quindi io sarei abbastanza tranquillo
comunque fai come detto