Vale87, nonostante quel che dicono in tanti, il film batterico, secondo me, non è così innocuo. Impedisce gli scambi gassosi sia in ingresso che in uscita. Tralasciando altri inconvenienti, nel nostro caso tu hai erogato CO2 e quella in eccesso non ha potuto liberarsi in atmosfera a causa del film batterico ed ha avuto tempo di sciogliersi completamente in acqua abbassando molto il pH.
Ora direi che, oltre a sospendere l'erogazione di CO2, potresti provare ad attivare un aeratore per un paio di giorni e vedere dove si vanno a stabilizzare i valori

Anche l'uscita a pioggia dal filtro va' bene.