Sono i nitrati quelli che si accumulano. Per ottenere una denitrificazione decente servirebbero zone estese con bassa presenza di ossigeno, difficilmente ottenibili in un normale filtro con materiali filtranti porosi che invece hanno lo scopo opposto, cioè quello di tenere ossigenati il più possibile i batteri che li colonizzano...
Per azzerare i nitriti basta un filtro correttamente dimensionato, ma per azzerare i nitrati serve un denitratore (sconsigliabile) o una forte e vitale presenza di organismi che se ne nutrono. Vasche piene di piante, opportunamente concimate e dotate di un'illuminazione alta sono un ottimo modo per tenere inquinanti come nitrati e fosfati a livelli molto bassi. In un acquario "normale" invece queste sostanze si combattono solo non sovrappopolando l'acquario e cambiando parte dell'acqua regolarmente. Aggiungere sostanze filtranti non influisce sull'accumulo dei nitrati, ma solo su quello dei nitriti.
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