In effetti è strano che si abbassi sia il KH che il GH

Se fosse solo il KH, ma in una vasca molto piantumata lo potrei capire. Cerca di descriverci la vasca partendo dal fondo, intendo i materiali usati.
Anche se non è corretto, prova a fare i rabbocchi dell'acqua evaporata non con RO ma con quella di rubinetto e vedi se noti una stabilizzazione o un incremento dei valori.