quello che vedi sul vetro sono diatomee, normali in un acquario allestito da poco.
per quanto riguarda il filtro, parli di una fanghiglia marrone? sono batteri buoni e sedimenti!
il vetro lo puoi pulire con lana di perlon o con la calamita o con cotone, il filtro non toccarlo: sciacqua soltanto le spugne e/o la lana di perlon di quanto in quanto e se vedi che diminuisce la portata.
ciao, ba